Blaue Bioökonomie ist definiert als die nachhaltige Nutzung der Ressource Wasser und des Meeres für biologische Produktionen. Konkret geht es im Innovationsraum „Bioökonomie auf Marinen Standorten“ unter dem Dach der Blauen Bioökonomie beispielsweise um die Produktion von Algen und wirbellosen Tieren als moderne Lebens- und Futtermittel, um die nachhaltige Produktion von Fischen und Krustentieren in Kreislaufanlagen, den Umgang mit überdüngten Gewässern und vieles mehr. Unter der Leitung der Christian-Albrechts-Universität zu Kiel werden mit 20 Millionen Euro Förderung des BMBF „blaue“ Projekte und Modellstandorte in Norddeutschland realisiert.